Научно-изследователската дейност на НРЛ по микология към отдела по микробиология е свързана с разработването на експериментални методи за изследване особеностите на микотичните инфекции и прилагането на практика на диагностичните методи.

Научно-изследователската дейност на референтната лаборатория по стрептококи и дифтерия се финансира от Национален Съвет "Научни изследвания" при Министерство на образованието и науката чрез участие в конкурси. До сега лабораторията е получила финансиране и е завършила работа по три договори.

Основни направления на научно-изследователската дейност на НРЛ по стрептококи и дифтерия са:

• Изследване на патогенността на клинични изолати Streptococcus pyogenes чрез генетични и фенотипни методи: продукция на пирогенни токсини, ензими, инвазини, М протеин. Прилагат се полимеразно-верижна реакция (PCR) за детекция на гени, кодиращи съответните фактори на патогенност, секвениране на emm гена, кодиращ М протеина, серотипизиране и др. методи.
• Проследяване на честотата и новото на антибиотична резистентност на клинични стрептококови изолати във времето; изследване на механизмите на макролидна резистентност чрез PCR за детекция на ermB, ermTR и mefA – гените, кодиращи различните механизми. Изследват се различните фенотипове и резистотипове.
• Епидемиологично маркиране на стрептококови изолати чрез генетични методи като emm секвениране, електрофореза в пулсово поле (PFGE) и др.

Основни направления на научно-изследователската дейност на референтната лаборатория по стафилококи са:

• Проучване на факторите на патогенност при S. aureus и коагулаза-негативни стафилококи с цел сравняване на щамове, изолирани при асимптомно носителство с такива от инфекции с различна локализация. Използват се методи като изследване на биофилм (слайм) продукция при S. aureus и CNS, PCR детекция на гени кодиращи фактори на вирулентност - ентеротоксини, токсик-шок синдром токсин-1, Panton-Valentine левкоцидини адхезини, като колаген- и фибронектин-свързващи протеини.
• Типиране на метицилин-резистентни Staphylococcus aureus (MRSA), изолирани в болници в различни райони на страната с оглед установяване на клоналните връзки между щамовете. Цел на проучванията са дефиниране на превалиращите в страната епидемични вътреболнични щамове MRSA, тяхното разпространение в страната и свързването им с определен генотип на токсин-продукция и определен фенотип на антибиотична резистентност.
• Характеризиране и типиране на придобити в обществото MRSA, сравняването им с придобитите в болниците щамове, както и проучване на факторите им на вирулентност, свързани с повишена патогенност, като Panton-Valentine левкоцидин. За типиране на стафилококови изолати лабораторията използва както фенотипни методи като фаготипиране, тако и генотипни методи като PCR-базирани техники, определяне на токсинови генотипове, макрорестрикционен анализ чрез електрофореза в пулсово поле (PFGE) и секвенционно типиране чрез секвениране на spa-гена, кодиращ протеин А (spasequencetyping). Лабораторията участва в Европейската програма Seqnet.org, представляваща мрежа от лаборатории, изпълняващи секвенционно типиране и обменящи резултати чрез интернет база данни. Програмата има за цел дефиниране на превалиращите клонове MRSA, разпространени в Европа.
• Носното носителство на S. aureus като рисков фактор за стафилококови инфекции – изследване с фено- и генотипни методи на връзката на носното носителство със стафилококови кожни инфекции, постоперативни раневи инфекции, катетър-свързани инфекции, бактериемии и др.

Епидемиологичното направление в дейностите на НЦЗПБ се осъществява от специалистите от отдел „Епидемиология и НЗБ“. Работата на отдела обединява научноизследователски и практически дейности, необходими за осигуряването на ефективен епидемиологичен надзор и контрол на заразните болести в страната, както и в Европейски мащаб.

Научноизследователската дейност на отдел „Епидемиология и НЗБ“ е в съответствие с актуални за страната теми, свързани с многообразни аспекти от областта на надзора и профилактиката на заразните болести. Отделът участва и в международни проекти в същата област в сътрудничество с Европейския център по превенция и контрол на заболяванията и със Световната здравна организация. Темите са разнообразни и включват: разработване и внедряване на устойчиви подходи за укрепване на националната система за надзор на заразните заболявания; проучвания върху подобряване на ваксинопрофилактиката и поддържане на ваксинопредотвратимите болести на нива в съответствие с препоръките на Световната здравна организация и респ. Европейския съюз, проучвания върху състоянието на инфекции свързани с медицинското обслужване в границите на страната и в европейски мащаб; проучвания върху методи и подходи за дезинфекция и стерилизация в разнообразие от обекти с обществено предназначение; проучвания върху някои видове членестоноги като преносители на заразни заболявания; проучвания върху биологичната ефективност на нови средства и формулации за дезинсекция и степента на резистентност към биоциди.

Резултатите, получени при разработване на посочените проекти, както и от други научни изследвания са публикувани в български и международни списания с насоченост в областта на инфекциозната патология, епидемиология и надзор на заразните болести.

В отдел „Епидемиология и НЗБ“ през периода 2013-2016 г. се работи по пет международни проекта:

1. Проект АСЕТ „План за действие във връзка с науката в обществото при епидемии и пандемии“ (ASSET Project „Action plan in Science in Society in Epidemics and Total pandemics“), по 7 РП, финансиран от Европейската комисия в съответствие с договор № 612236. Срок за изпълнение: 2014 г. – 2017 г.

2. Проект TRICE-IS (Implementation of a training strategy for Infection Control in the European Union), 2012- 2015. Срок за изпълнение: 2014 г. – 2016 г.

3. Проект ВЕНИС ІІІ „Мрежа за мониториране и оценка на европейските имунизационни системи” (VENICE III Project ”Vaccine European New Integrated Collaboration Effort Project”), 2013-2016 г. Срок за изпълнение: 2014 г. – 2016 г.

4. Проект "Подобряване на надзора на ваксинопредотвратимите инфекции: Разработване на модел за уеб-базиран имунизационен регистър". (Project "Improvement of surveillance of vaccine-preventable diseases: development of a model of web-based immunization register”), BG 07: Programme“Public Health Initiatives” with the financial contribution of the Norwegian Financial Mechanism and the Financial Mechanism of the European Economic Area 2009-2014. Срок за изпълнение:19 ноември 2014 г. – 30 април 2017 г.

5."Мрежа за контрол на заплахите за общественото здраве и други биологични заплахи в Средиземноморския регион и Балканските страни" (EPISOUTH PLUS Project "The network for the control of public health threats and other bio-security risks in the Mediterranean region and Balkans"), GrandAgreement 2009 11 05 – EpiSouthPlus. Проектът завърши в началото на 2014 г.

През периода 2013-2015 г. академичният състав на отдел „Епидемиология и НЗБ“ има общо 108 публикации, от които 17 са публикациите в международни медицински списания с импакт фактор. Публикации с авторско участие на научно-преподавателските кадри на отдел Епидемиология и НЗБ са цитирани през периода 2013-2015 г. в общо 398 научни публикации, от които 388 са в международни списания (284 в списанияс импакт фактор и 104 в списания без импакт фактор). Общият импакт фактор на отдела за атестационния период 2013-2015 г. е: 59,268.

Участията в национални и международни научни мероприятия през периода 2013-2015 г. са с общо 68 доклада и постери от които 59 са представени на български и 9 на международни научни форуми.

През последните три години в отдела са обучавани трима докторанти, всеки от които има участие в български и международни научни форуми.

В отдел „Епидемиология и НЗБ“ се провежда следдипломно обучение на медицински специалисти по програми за следдипломна квалификация, вкл. обучение в тематични курсове и индивидуално обучение по определени теми, свързани с надзора и профилактиката на заразните болести. В отдела се провежда и обучение на докторанти и на специализанти по епидемиология, вирусология, микробиология и паразитология, в съответствие с учебните програми по съответните специалности.

Отдел „Епидемиология и НЗБ“ провежда и обучение за ръководители и изпълнители на ДДД дейности (за повече информация: Този имейл адрес е защитен от спам ботове. Трябва да имате пусната JavaScript поддръжка, за да го видите.).

Информация за курсовете за СДО на отдел ЕНЗБ, както и актуалната "Програма курсове за СДО" за 2016 г.   можете да получите тук:http://www.ncipd.org/images/UserFiles/File/SDO/SDO_2016.pdf

Специфичната дейност на отдел „Епидемиология и ДДД” е свързана с изпълнението на следните основни противоепидемични дейности:

• Изготвяне на периодични оперативни оценки и годишни анализи на заразната заболяемост, противоепидемичните и профилактични мерки и диагностичнатадейност.
• Участие в организирането и провеждането на цялостния епидемиологичен надзор на острите заразни болести, подлежащи на задължително съобщаване, регистрация и отчет в България.
  • Изготвяне на оперативни ежедневни, седмични и месечни анализи на заболяемостта. Седмичната оперативна епидемиологична информация се публикува в сайта на НЦЗПБ в рубриката "Епидемиологичен бюлетин".
  • Изготвяне на отчети, информации и анализи относно заразните заболявания и имунизациите в страната, изисквани от Световната здравна организация (СЗО) и Европейския съюз (ЕС).
  • Осигуряване на епидемиологична информация и данни за заразните заболявания в България за международни организации (СЗО и ЕС).
  • Участие в международни проучвания чрез предоставяне на данни, епидемиологична информация и експертна оценка.
  • Пряко участие на специалистите от отдела в проверки на МЗ и в разрешаването на проблеми, свързани с диагностиката, лечението, противоепидемичните и профилактични мерки при възникване на епидемични ситуации.
  • Изготвяне и предоставяне на обществеността на информация, касаеща конкретни епидемични ситуации или разпространението и начините на предпазване при социално-значими заразни заболявания. Изготвяне на писмени отговори на въпроси на граждани и участие в интервюта, радио- и телевизионни предавания.
  • Рутинен национален епидемиологичен надзор на заболяванията, за които има изградени специализирани мрежи за надзор:

ü  Надзор на грип и ОРЗ: заболяемостта от грип и ОРЗ се проследява от Национална информационната система за събиране и анализиране на данниза заболяемостта от грип и ОРЗ;

ü  Надзор на морбили, паротит и рубеола: разработена е интернет базирана система за надзор на морбили, паротит и рубеола. Чрез системата се осъществява събиране, обработване и анализ на индивидуални клинични, епидемиологични и лабораторни данни за заболелите;

ü  Надзор на нежеланите реакции след ваксинации и изготвяне на анализ и доклад за нежеланите реакции след ваксинации.

Научно-изследователската дейност на отдел Имунология се осъществява в няколко направления:
- осигуряване на комплексна съвременна диагностика на имунния отговор срещу микроорганизми посредством интегрирано използване на клетъчни, молекулярни и генетични методи
- изясняване на механизмите на патологичен имунен отговор срещу микроорганизми, в т.ч.: животозастрашаващи остри инфекции, социално значими хронични инфекции, алергии.
- транслиране на резултатите от фундаменталните изследвания в клиничната практика под формата на методи за изследване, диагностични алгоритми, конструиране и валидиране на имунодиагностични и имунотерапевтични средства.

Крайната цел е създаване на технологии за бърза и правилна начална и съпътстваща диагностика, съобразена с индивидуалните характеристики на пациента; избор на подходящо и безопасно лечение, ефективен и персонализиран мониторинг на резултатите от приложената профилактика и терапия.
Имунологичният отдел на НЦЗПБ има солиден опит в областта на изследвaнето на клетъчния имунитет. Тук през 1987 г. се поставя началото на изследване на антигенната структура на човешките кръвни клетки с помощта на моноклонални антитела в България и има директен принос за създаването на международната CD класификация на левкоцитните антигени. НРЛ по имунология е основното звено за имунологичен мониторинг на ХИВ+ пациенти в страната от 1999 г. насам. Колективът има доказан опит в изследването на ролята на регулаторните Т-лимфоцити и други фактори, регулиращи клетъчния имунен отговор. НРЛИ е първата лаборатория в България, въвела in vitro тестове (IGRA) за установяване на инфектираност с МТВ и има опит във флоуцитометричната оценка на МТВ-специфичния Т клетъчен отговор. В НЦЗПБ е поставено началото на научно-изследователската дейност в областта на анитбактериалния лигавичен имунитет в България, свързана с разработването на in vitro методи за оценка на патоген-специфични секреторни антитела и характеризирането на имуномодулатори с локално действие.

През 2019 г. в отдела се разработват следните теми с външно финансиране:

1. „Ефекторни и регулаторни механизми на протективния Т-клетъчен имунен отговор срещу Mycobacterium tuberculosis“. България е сред шестте европейски страни с относително висока честота на нови случаи, мултирезистентни форми (MDR-TB) и рецидиви. Механизмите, които регулират МТВ-специфичния имунен отговор, не са напълно изяснени. Поради това не съществува надежден подход за прогнозиране на развитието на инфекцията и ефекта от специфичната терапия. Целта на проекта е изследването на основните ефекторни и регулаторни Т-клетъчни субпопулации през отделните фази на инфекцията, във връзка с експресията на дискретни набори от гени на инфектиращия микроорганизъм, и идентифицирането на биомаркери на протективния MTB-специфичен имунен отговор.

2. „Т-регулаторни субпопулации и механизми на имуномодулация при IgE-медиирана алергия“. Алергиченият ринит и астмата засягат повече от 100 милиона европейци. Алергиите са подценявана причина за нездравословно стареене. Предполага се, че T регулаторните клетки (Тreg) играят ключова роля в патогенезата на IgE-медиираната алергия. Настоящият проект има за цел да се проучи ролята на различните типове Т регулаторни клетки (nTregs; Tr1 и CD8(+) Тregs) за развитие на сенсибилизация при български пациенти с изявена IgE-медиирана алергия, както и да се установят основните механизми на имуномодулация и вързките между регулаторните клетки за възстановяване на периферната толерантност в хода на специфична имунотерапия с алергени.

3. „Роля на желязната хомеостаза за хроничното възпаление при HIV инфекция“. Инфекцията с HIV причинява персистиращо имунно възпаление, включително на фона на cART. Нискостепенната активация поддържа латентни вирусни депа и води до редица не-свързани с HIV усложнения като проява на ускорено остаряване на организма. Сред множеството физиологични фактори, повлияващи репликацията на HIV, значителна роля играе вътреклетъчното желязо, което е необходимо за обратната транскрипция на HIV и синтеза на вирусния капсид. Намаляването на пула на вътреклетъчното лабилно желязо (LIP) е защитен механизъм срещу HIV инфекцията, докато повишеното му ниво се свързва с по-бързо прогресиране и корелира обратно с преживяемостта на инфектираните пациенти. По този начин основните регулатори на клетъчния метаболизъм на желязото - хепсидин и феропортин се очертават като възможни индикатори за активността на HIV инфекцията. Проекът има за цел да проучи ефектите на желязната хомеостаза върху имунното възпаление и имунното възстановяване при пациенти с недоловим HIV вирусен товар на фона на cART. Резултатите от предложения проект ще доведат до идентифицирането на потенциални предиктори за реактивиране на латентните HIV резервоари и ще генерират нови познания за ролята на желязната хомеостаза при хроничните инфекции.

4. „Оценка на Т - клетъчния имунитет при възрастни клинично здрави лица в активна възраст“. През последните десетилетия се наблюдава увеличаване на продължителността на живот в световен мащаб. Удължената продължителност на живот корелира с по-висока честота на хронични, дегенеративни и туморни заболявания, както и с физиологични промени в дейността на имунната система, означавани като имунологично остаряване. То се характеризира с количествени и функционални промени, засягащи имунната система на различни нива. Хроничните прогресиращи инфекции могат да се определят като модел на ускорено остаряване.Целта на проучването е пилотна оценка на имунния статус на българското население в активна възраст за признаци на преждевременно имунологично остаряване.

ПУБЛИКАЦИИ НА НАУЧНИЯТ КОЛЕКТИВ НА ОТДЕЛ ИМУНОЛОГИЯ ПРЕЗ ПОСЛЕДНИТЕ 5 ГОДИНИ

Основните научни направления в отдела по вирусология са следните:

По проблема грип основното научно-приложно направление е приложението на съвременни методи за разшифроване етиологията на грипните епидемии у нас. В последните години в лабораторията по "Грип и ОРЗ" наред с класическите методи на диагностика е внедрен и молекулярно-биологичният метод RT-PCR за типова характеристика на генома на грипните вируси, както и за субтипиране на хемаглутинина и невраминидазата на грипните вируси от тип А.

Ефективно се използват съвременни модификации на бързите имуноензимни и имунофлуоресцентния методи. Прилагат се някои методи за генетичен анализ на грипните вируси. Изработена е ефективна схема за изследванията на грипа, включваща комплекс от класически и съвременни методи и приложима както по време на сезонните грипни епидемии, така и при евентуална поява на нов пандемичен грипен вирус. През 2006 г. е защитена докторска дисертация по проблемДруго научно направление в лабораторията е определяне ролята на инфекция, причинена от респираторно-синцитиалния вирус при деца. Във връзка с това се провеждат диагностични проучвания при деца до 2 годишна възраст с тежка респираторна симптоматика.

Колективът на лабораторията от години извършва и научни проучвания, свързани с имунизационната практика на грипа у нас. Установяването на по-висока имуногенност на грипните ваксини в комбинация с имуностимулиращи препарати има значение за профилактичната практика при грипа.

Основните насоки в дейността на лаборатория "Хепатитни вируси" са проучвания свързани с етиологията, разпространението и профилактиката на хепатотропните вируси HAV,HBV,HDV,HCV,HEV в страната. Като продължение и развитие на направлението, разгърнато от създаване на лабораторията, свързано с проучването на новооткритите хепатотропни вируси, бяха получени първите данни за страната относно наличието на хепатит Е вирусна инфекция, която се представя в единични клинично проявени случаи и подобно на данни от други европейски страни, не представлява сериозна заплаха за страната.