В НЦЗПБ чрез целогеномно секвениране от ново поколение успешно бяха анализирани 505 клинични проби със SARS-CoV-2.
При 52 пациента с COVID-19, беше установен вирусен вариант Омикрон на SARS-CoV-2. Клиничните проби с Омикрон са взети в 13 лечебни заведения от 9 области в страната в периода от 20.12.2021 г. до 03.01.2022 г. с изключение на една от пробите, взета на 13.12.2021 г. и постъпила на 29.12.2021 г. в НЦЗПБ.
Общо при изследването се установи, че 52 (10.3%) проби са с Омикрон (BA.1) и 453 (89.7%) са Делта (B.1.617.2) или подварианти на Делта (AY.*).
За справка относно класификацията на вариантите и подвариантите на SARS-CoV-2, моля, посетете: https://cov-lineages.org/index.html.
Окончателният анализ за дефиниране на вирусните варианти е извършен с помощта на програма Nextclade v1.11.1. и Pangolin COVID-19 Lineage Assigner v3.1.17.
Разпространението на вариантите на SARS-CoV-2 в различни области на страната е представено в таблицата към тази справка.
Таблица с разпространение на вариантите на SARS-CoV-2 в различни области на страната.
*Справката за състоянието на пациентите е към 20.12.2021-05.01.2022 г. Провежда се допълнително епидемиологично проучване.
За актуална класификация на вирусните варианти с повишено значение за общественото здраве, моля посетете:
https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
НЦЗПБ продължава да наблюдава разпространението на SARS-CoV-2 в страната с акцент за търсене на варианти с ускорено разпространение, променена вирулентност и имуногенност, които са с повишено значение за общественото здраве.