В НЦЗПБ чрез целогеномно секвениране от ново поколение успешно бяха анализирани 275 клинични проби със SARS-CoV-2.
За първи път в България е установен вариант Омикрон. Касае се за 12 пациента с COVID-19, при които беше установен вирусен вариант Омикрон на SARS-CoV-2, всички са карантинирани на домашно лечение, няма хоспитализирани. Клиничните проби са взети в 4 лечебни заведения в периода от 16 до 22 декември 2021 г., 11 пациенти са от София Столица, а един от област София.
Общо при изследването се установи, че 12 (4.4%) проби са с Омикрон (B.1.1.529) и 263 (95,6%) са Делта (B.1.617.2) или подварианти на Делта (AY.*).
За справка относно класификацията на вариантите и подвариантите на SARS-CoV-2, моля, посетете: https://cov-lineages.org/index.html.
Окончателният анализ за дефиниране на вирусните варианти е извършен с помощта на програма Nextclade v1.10.0. и Pangolin COVID-19 Lineage Assigner v3.1.16.
Клиничните проби са взети от пациенти с COVID-19 в периода 15.11-22.12.2021 г. и са изпратени от 41 различни лечебни заведения от 21 области на страната.
Таблица с разпространение на вариантите на SARS-CoV-2 в различни области на страната.
*Справката за състоянието на пациентите е към 06-29.12.2021 г. Провежда се допълнително епидемиологично проучване.
За актуална класификация на вирусните варианти с повишено значение за общественото здраве, моля посетете:
https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
НЦЗПБ продължава да наблюдава разпространението на SARS-CoV-2 в страната с акцент за търсене на варианти с ускорено разпространение, променена вирулентност и имуногенност, които са с повишено значение за общественото здраве.