Научно-изследователска дейност на отдела по паразитология и тропическа медицина е насочена в две основни направления:

а) С научно-приложен характер: проучване етиологията, епидемиологията, клиниката, диагностиката, лечението и профилактиката на паразитните болести - местни и тропически. Това направление е пряко свързано с общественото здравеопазване и подобряване здравната помощ за населението.

б) С фундаментален характер: проучване взаимоотношението паразит-гостоприемник на молекулярно, клетъчно, организмово и екологично ниво.

Настоящите научни проекти, по които работят сътрудниците в отдела са три:

ПРОЕКТ: BG05M2OP001-1.002-0001 „Фундаментални, транслиращи и клинични изследвания в областта на инфекциите и инфекциозната имунология”, финансиран от Оперативна Програма „Наука и образование за интелигентен растеж“

КП-06-Н-33/18 „Молекулярно-генетични проучвания върху разпространението на пневмоцистозата при хората в България“ (ръководител доц. Нина Цветкова, дб), одобрен за финансиране от Фонд научни изследвания.

КП-06-Н-41/5 „Биологични и молекулярно-генетични проучвания върху инсектицидната резистентност на местни и инвазивни видове комари“ (ръководител гл. ас. Огнян Миков, дб), одобрен за финансиране от Фонд научни изследвания.

КП-06-Н-43/2 „Проучвания върху клетъчния и хуморален имунен отговор при пациенти с остра и хронична форма на токсоплазмоза“ (ръководител проф. Искра Райнова, дмн), одобрен за финансиране от Фонд научни изследвания.

За периода 2016 – 2020 г. година научната активност на сътрудниците в отдела се изразява в публикуването на 52 журнални статии, от които 22 (42%) в научни списания с импакт фактор. Общият импакт фактор (IF) на публикациите е 42.102. Сътрудниците са участвали в написването на 29 глави от монографичен труд Клинична паразитология и тропическа медицина. Петров П., Р. Курдова (ред.), София, „Изток-Запад”, 2016, и имат 125 участия с доклади и постери в научни прояви, от които 22 в чужбина. Сътрудниците на отдела имат 414 цитирания за пет-годишния период, от които 196 (47%) в издания с импакт фактор. В отдела по паразитология и тропическа медицина са защитени 10 дисертационни труда, от които девет за придобиване на ОНС „Доктор“ и една за придобиване на НС „Доктор на науките“. Пет от аналитичните специалисти (лекари и биолози) са с придобита образователна и научна степен „доктор” и един с придобита научна степен „доктор на науките“. Шест от сътрудниците заемат академични длъжности както следва: един професор, двама доценти, и трима главни асистенти.